安捷倫推出分析基因調(diào)控的芯片平臺 (2005-09-19)
發(fā)布時(shí)間:2007-12-04
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安捷倫科技公司于9月12號推出了它的用于分析基因組調(diào)控區(qū)域活動(dòng)的CHIP-on-chip芯片平臺。真核生物的基因組DNA以染色質(zhì)的形式存在。因此,研究蛋白質(zhì)與DNA在染色質(zhì)環(huán)境下的相互作用是闡明真核生物基因表達(dá)機(jī)制的基本途徑。染色質(zhì)免疫沉淀技術(shù)(chromatin immunoprecipitation assay, CHIP)是目前唯一研究體內(nèi)DNA與蛋白質(zhì)相互作用的方法。
它的基本原理是在活細(xì)胞狀態(tài)下固定蛋白質(zhì)-DNA復(fù)合物,并將其隨機(jī)切斷為一定長度范圍內(nèi)的染色質(zhì)小片段,然后通過免疫學(xué)方法沉淀此復(fù)合體,特異性地富集目的蛋白結(jié)合的DNA片段,通過對目的片斷的純化與檢測,從而獲得蛋白質(zhì)與DNA相互作用的信息。CHIP不僅可以檢測體內(nèi)反式因子與DNA的動(dòng)態(tài)作用,還可以用來研究組蛋白的各種共價(jià)修飾與基因表達(dá)的關(guān)系。CHIP與其他方法的結(jié)合,可以擴(kuò)大了其應(yīng)用范圍,如CHIP與基因芯片相結(jié)合建立的CHIP-on-chip方法已廣泛用于順式作用因子的高通量篩選。
這項(xiàng)技術(shù)對于大規(guī)模挖掘這類順式調(diào)控信息成績卓著。小鼠、大鼠等其他模式生物全基因組測序的完成,促進(jìn)了人類基因組研究的進(jìn)程。如今,比較基因組學(xué)(comparative genomics)策略不僅可用來精確的預(yù)測編碼基因,還可用于高通量尋找這部“天書”中大量的順式調(diào)控序列。同時(shí)它可以用于胚胎干細(xì)胞和一些疾病如癌癥、心血管疾病和中央神經(jīng)系統(tǒng)紊亂等發(fā)生的機(jī)制。研究人員還可以利用這項(xiàng)技術(shù)開發(fā)一些治療方法。